Yer yapısı, kısmen II.Jeolojik zamanda meydana gelmiÅŸtir. Tarihi Boyabat Kalesinin bulunduÄŸu kayaların temeli billuri ÅŸistlerden üzeri tebeÅŸir devri kalkeridir.Boyabat arazisi engebelidir. Ä°sfendiyar daÄŸları ve doÄŸu Ilgaz sıradaÄŸlarının kapladığı alan Boyabat’a aittir. Bu sıradaÄŸlar arasında akarsu yatakları , bazı düzlükler ve yaylalar bulunmaktadır.
Ä°lçe sınırından geçmekte olan Gökırmak bir vadi meydana getirmiÅŸtir.Bu vadi tabanında tarımsal deÄŸeri yüksek kültür arazileri oluÅŸmuÅŸtur. Bu toprakların % 60′ı sulanabilmektedir. Yüksek daÄŸlar ve tepeler kısmen ormanlık, kısmen fundalık, büyük bir kısmı da çıplaktır.
Belli başlı dağları Karageriş,Elekdağı, ve Dıranazdır.
Deniz etkisinden uzak olan Boyabat’ta genellikle karasal iklim görülür. Yazlar sıcak, kışlar soÄŸuktur. YaÄŸmur en çok ilkbaharda yaÄŸar.Ortalama yağış miktarı 400-500 mm civarındadır.
